築城年代は定かではないが室町時代に赤松氏が砦を築き、その後三木城主別所長治の叔父の別所吉親が城主となったと云われる。

天正13年(1585年)高山右近(重友)が摂津国高槻より明石へ転封となり、船上城を改修して居城とした。しかし、豊臣秀吉によるキリスト教弾圧により、高山右近は改宗を迫られるもそれを固持して追放された。

関ヶ原合戦の後は姫路に入封した池田輝政の子池田利政家が城代となり、姫路城の支城となった。慶長18年(1613年)輝政が没すると備前国下津井城代であった池田由之が移ったが、元和2年(1616年)姫路藩の家督を継いだ光政が幼小であることから因幡国鳥取へ転封となると由之もまた伯耆国米子城代として移った。

元和3年(1617年)信濃国松本から十万石で入封した小笠原忠政が船上城に入ったが、すぐに明石城を築いて移り廃城となった。

現在は市街地と田畑に埋没しており、わずかに本丸跡とされる台地が残り古城御大神が奉られている。

最寄り駅(直線距離)
0.6km 西新町駅
1.1km 林崎松江海岸駅
1.6km 山陽明石駅
1.6km 明石駅
2.5km 西明石駅

付近の城(直線距離)
1.6km 播磨 明石城
2.3km 播磨 枝吉城
3.2km 播磨 下津橋城
5.0km 淡路 松帆台場
5.2km 淡路 岩屋城(まないた山城)
5.5km 摂津 明石藩舞子台場
5.9km 播磨 福中城
6.1km 播磨 脇村構居
7.2km 播磨 魚住城
7.6km 播磨 小寺城
7.8km 淡路 岩屋城(絵島ヶ丘城)
8.1km 播磨 魚住古城
8.3km 播磨 池谷城
10.0km 播磨 城ヶ谷城

2008年8月