城主は小倉美作守、小倉佐介(小倉美濃守重信)などが伝えられる。
天文22年(1553年)小倉重信は芝原城主久米義広とともに槍場の合戦で三好実休と戦ったが敗れて討死したという。
『古城諸将記』には「小倉美作守 源氏、百貫」とある。
蔵本城は蔵本駅の北西側一帯で「城ノ内」と呼ばれるあたりが伝承地となっており、線路の北側にあるマンションの一角に城主を祀った祠があり、蔵本城の案内板が設置されている。
『徳島県の中世城館』によれば、このマンションの建設に伴って試掘調査が行われたが、遺構、遺物は発見されなかったようだ。