寛文8年(1668年)京極高門によって築かれた。
寛文8年(1668年)丹後国田辺から京極高盛が豊岡に転封となると、二千石で丹後に分地されていた弟高門は同じく二千石を所領し糸井に陣屋を構えた。

現在の郷土資料館や幼稚園の敷地となって部分が陣屋跡で、陣屋門が現存している。

最寄り駅(直線距離)
2.5km 和田山駅
3.0km 養父駅
5.6km 梁瀬駅
7.2km 竹田駅
8.0km 八鹿駅

付近の城(直線距離)
0.7km 但馬 林垣城
0.9km 但馬 林垣向山城
1.0km 但馬 高生田城
1.6km 但馬 土田陣屋
1.7km 但馬 鳶ヶ城
1.9km 但馬 高田向山城
2.1km 但馬 寺谷城
2.2km 但馬 土田観音山城
2.6km 但馬 岡田城
2.7km 但馬 室尾寺城
3.0km 但馬 和田城
3.0km 但馬 高尾山城
3.1km 但馬 法道寺城
3.3km 但馬 尻木谷城
3.5km 但馬 岡城
3.8km 但馬 芳賀野城
3.8km 但馬 岡比丘尼城
4.0km 但馬 玉置城
4.0km 但馬 弥高山城
4.1km 但馬 宮谷東城
4.3km 但馬 石禾城(北城)
4.4km 但馬 久田和城
4.4km 但馬 石禾城(南城)
4.5km 但馬 枚田城

2016年10月