『芸藩通志』には「藤丸 上石、志路原、二村の界にあり、上見木工所居、一二氏を安井 作る、」とある。『日本城郭全集』では「木工」を二宮木工助として吉川家臣とする。
藤ヶ丸城は比高90mほどの山に築かれている。
藤ヶ丸城は上の城(南郭)と下の城(北郭)とにはっきりと分かれており、案内板によれば北郭は正願寺跡と伝えられているようである。現在木々が切り払われて植林されているが、城跡整備に伴うものではない。
下の城(北郭)は最高所II1がほぼ方形で南半分に土塁が設けられている。北東下にII2があるが段差は小さい。西尾根に堀切2、北尾根に堀切1があり区画される。南尾根にも溝(堀切3?)があるが、谷筋からの山道が合流しており切通のようでもある。
上の城(南郭)は最高所のI1から北に向かって三段の曲輪がある。主郭I1には南端に土塁があり、最下段のI3も南端を竪土塁として残してある。南鞍部は切通で堀切ではなさそゔてある。
たまたまお話を聞いたのが地主の方で、東の谷間から登っていけるとのこと。現状筋の道は熊笹に覆われてわかりにくくなっている。
案内板は北の国道沿いにある。