明治3年(1870年)細川利永によって築かれた。 高瀬藩は寛文6年(1666年)熊本藩主細川光尚の二男利重が新田高のうち三万五千石を分知され肥後新田藩となったのがはじまりで、参勤交代を行わず代々江戸に在住した定府大名であった。

慶応4年(1868年)細川利永は江戸から肥後に下向し、高瀬町奉行所を置いて仮住まいとし、明治3年(1870年)5月には高瀬陣屋を築き始めたが、明治3年9月に本藩である熊本藩と統合されるにいたり陣屋の建設は中止された。

高瀬陣屋は現在の玉名町小学校とその隣の玉名女子高校一帯に築かれていた。 現在遺構はなく、小学校の南側の正門から少し入った所に案内板と高瀬藩校「自明堂」跡、弥富尋常高等小学校跡の標柱がある。

最寄り駅(直線距離)
0.9km 玉名駅
3.6km 肥後伊倉駅
5.1km 大野下駅
6.9km 木葉駅
9.3km 長洲駅

付近の城(直線距離)
0.3km 肥後 岩崎城
0.9km 肥後 高瀬城
1.4km 肥後 高岡城
2.2km 肥後 築地館
2.4km 肥後 城ヶ崎城
2.7km 肥後 築地次郎国秀館
3.5km 肥後 日嶽城(亀城)
3.8km 肥後 伊倉の中城
3.9km 肥後 日嶽城(鶴城)
4.0km 肥後 下村城
4.1km 肥後 高道城
4.3km 肥後 上村城(岱明町)
4.3km 肥後 中土館
4.9km 肥後 内野城
5.2km 肥後 溝上城
5.5km 肥後 稲佐城
5.7km 肥後 横島城
5.9km 肥後 赤崎城
6.0km 肥後 扇崎の館
6.4km 肥後 鶯原城
6.4km 肥後 筒ヶ嶽城
6.6km 肥後 日平城
6.7km 肥後 梅尾城
6.9km 肥後 木葉城

2011年2月