『芸藩通志』には「古壘 上河内村にあり、河内肥後居所、或いは渡邊飛騨(肥後とも)ともいふ、詳ならず、」とある。
山根城は河内小学校の北西にある標高120mほどの山に築かれており、現在は公園として登山道が整備されている。
最高所は曲輪群Iで、『ふるさと河内 古今探訪(河内地区社会福祉協議会、河内まちづくり協議会)』によれば「丸子山」と呼ばれている。南の曲輪群II、IIIが「城山」で同書掲載絵図には「本丸、二の丸、三の丸、蔵屋敷」と記されている。
主郭Iは南北二段であるが、北側はほぼ自然尾根をそのまま土壇として残しており削平しているのは南側のみである。主郭の北背後には大きな堀切2があり、さらに少し登った所に浅い堀切1が確認できる。
曲輪群IIはII1を中心に南北に小さな段を設けている。北側のII5は墓地造成による改変があり、主郭Iと区画する堀切3を設けている。また西へ伸びる支尾根は堀切4で遮断しており、その先の尾根は緩斜面ではあるが明確な曲輪の造成は確認できない。
南端は「絵図に蔵屋敷」と記されている曲輪IIIで城内で最も広い。さらに下方には墓地造成された平場がいくつか確認できるが遺構かどうかは不明である。
登口は2ヶ所あり、南麓の登口1は入口に道標があるのでわかりやすい。駐車場はない。
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