一条氏方の篠田宗円、津島宗雲が津島陣に布陣したため、これを迎え撃つ長宗我部方の宿毛出井城主沖長門守良貞が小串城を築いて対峙したという。津島陣を参照。
小串城は黒尊川南岸、標高254.1mの三角点のある山に築かれている。
三角点のある場所は山頂よりやや下った北側にあるが、山頂部全体がなだらかな地形になっており、城はその最高所に築かれている。
南北二郭で南端最高所にI、北に隣接して曲輪IIがある。
主郭は土塁囲みで北東隅が開口して虎口となり曲輪IIと接続していたようであるが、現状では東側の切岸部分もエッジがなく緩やかに傾斜している。この部分が曲輪IIの虎口とも考えられるが、現状では不明である。
曲輪IIは南北に長い方形で西から北側に土塁があり一部石積、石列が確認できる。
城の北側は幅広の緩斜面が続くが、竪堀が長く伸びる堀切4で遮断する。西側面は横堀と畝状竪堀群3があるが竪堀はいずれも短い。
主郭の南背後は堀切1で遮断する。堀切から伸びる竪堀と接続する横堀5と竪堀5がある。西側には小規模な堀切4があり、堀切2と1の間に竪堀が一条ある。
曲輪IIの東側面は切岸下方に緩斜面が広がるが堀を設けていない。敵対する津島陣が北西にあることを考えれば、この部分に堀がないのは理解できる。
北麓に作業林道の入口があり、その一部が城の背後の尾根を通っているので、そこからアクセスすると楽に行くことができる。