聖武天皇が建立した越後国分寺の所在は未だ分かっていない。現在上越市五智に五智国分寺という寺院があり、これは永禄年間(1558年〜1570年)に上杉謙信が廃寺同前になっていたものをこの地に再興したもので、国分寺の後継寺院となっている。

五智国分寺には安政3年(1856年)に再建された三重塔がある。