築城年代は定かではない。天正9年(1581年)前田利家が能登へ入国した際に一時在城したと伝えられる。 能登に入部した利家ははじめ羽咋郡飯山に居城を置いたが、水の便が悪いので菅原城へ移り、能登一国を領した後は、小丸山城を築いて移ったという。

城は菅原神社の南にある丘陵の頂部に築かれている。 東西に伸びる尾根に曲輪を配し、堀切によって曲輪を区画している。 西の曲輪は北側に土塁が残るが、他の曲輪に土塁は見られない。東の方には二重の堀切も残っている。

菅原神社を目指す。ここから南へ続く道を進んで行き、山に近くなると左側に明見大菩薩が見えるのでそちらへ進む。ぐるりと回り込んだ所に山へ通じる道がある。その先にも山に通じる道があり、そちらの方が道は良好である。