築城年代は定かではないが戦国時代に長野氏によって築かれたと云われる。

天正年間(1573年〜1592年)に島津氏が南郷に攻め寄せた時、長野城主長野惟久は南郷城へ入り島津軍と戦ったが敗れて討死した。

城は長野阿蘇神社の所にあり、神社の北側に堀と土塁が残っている。神社の東側の道を北へ行くと標柱が建ち、広場に城石碑が建っている。