元禄年間に幕府によって築かれたのが始まりという。当初代官所は南会津町役場の西に設けられ、寛政2年(1790年)には東側に中町陣屋を築いて移し、慶応元年(1865年)に後町陣屋を築いて移したという。

南会津町役場前に石碑と案内板がある。