延徳2年(1490年)松浦丹後守定によって築かれたと云われる。 延徳2年(1490年)丹後守定の時、惣領相神松浦氏は大智庵城を築いて武辺城より移ったという。

明応7年(1498年)丹後守定の子政の時、平戸松浦弘定によって攻められ落城、政は自刃して果て、その子幸松丸は平戸へ連れ去られ、惣領相神浦松浦氏は没落した。その後、旧臣によって幸松丸は奪還され、唐船城で育った後丹後守親(ちかし)と名乗り飯盛城を築いている。

大智庵城は相浦川の南岸の丘陵に築かれており、現在は大智庵城址公園として整備されている。円形の本丸には城主松浦丹後守政の墓がある。周囲には空堀が巡らされていたと云うが現在はほとんど残っていないようである。

国道498号線沿いに大智庵城址公園への道標がある。