築城年代は定かではない。城主は石黒太郎光秀の二男石黒宗五郎、佐々成政の家臣山本志摩守が伝えられる。

山本城は西の山塊から東へ伸びた低丘陵に築かれている。 過去の圃場整備によって曲輪の一郭が残っているといい、過去の形状は不明であるが、現状では東へ伸びた低丘陵の先端部分にある。西の背後はやや低い畑を挟んで続いており、空堀跡のように見える。